华中农业大学Nature Genetics：一种新染色体构象捕获技术

深圳子科生物（https://show.guidechem.com/zikerbio/）报道：Hi-C技术是三维基因组学的主要研究方法，但存在实验成本高、数据噪音大、实验过程繁琐等缺点。来自华中农业大学的研究人员近期发表了题为“Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture”的文章，提出了一种新染色体构象捕获技术——DLO Hi-C，这种方法降低了背景数据噪音，高质量低成本获取Hi-C数据。

这一研究成果公布在4月26日的Nature Genetics杂志上，文章的通讯作者为华中农业大学的“楚天学者特聘教授”曹罡与李国亮教授，第一作者为林达与洪萍。同期Nature Genetics也配发了评论性文章，指出这篇文章“引入关键的双连线策略，能过滤噪音，同时进行早期质量控制。”

Hi-C技术是三维基因组学的主要研究方法，新的DLO Hi-C染色体构象捕获技术，采用同时酶切酶连的方式，将DNA接头连接在染色体内切酶切口末端上，然后进行邻近酶连，最后将用MmeI内切酶酶切消化，回收固定大小互作DNA片段，从而大大地降低了背景数据噪音，获取质量高于传统Hi-C的数据。DLO Hi-C技术还可以用于染色体易位位点筛选。

DLO Hi-C技术使全基因组染色体构象捕获实验的成本大大的降低，同时简化了实验步骤，使得实验成功率显著提高，对辅助基因组组装、解析基因组远程调控元件的功能、理解疾病易感位点、以及检测染色体结构变异有着重要的意义。

这种DLO Hi-C技术为解析基因组三维结构提供了一种新型高效、经济的研究方法。